наименование товара |
Лигаза 3'-фосфат / 5'-гидроксинуклеиновой кислоты |
Пример структуры |
|
Синонимы |
3'-P RNL, MXAN_0280, MXAN_4982, лигаза для сплайсинга РНК, rtcB, RtcB РНК лигаза, Rtcb-1, RtcB1, Trl1, лигаза для сплайсинга тРНК, лигаза для сплайсинга тРНК |
Номер EC |
6.5.1.8 |
Номер CAS Registry |
|
Комментарии |
Фермент представляет собой GTP- и Mn2 + -зависимую 3'-5'-лигазу нуклеиновых кислот со способностью присоединять РНК с 3'-фосфатными или 2 ', 3'-циклическими фосфатными концами к РНК с 5'-гидроксильными концами. Он также может соединять ДНК с 3'-фосфатными концами с ДНК с 5'-гидрокси-концами при условии, что концы ДНК не спарены [6]. Фермент обнаружен у представителей всех трех царств жизни и необходим в многоклеточных животных для сплайсинга интрон-содержащих тРНК. Реакция следует трехступенчатому механизму с начальной активацией фермента гидролизом GTP, образуя фосфорамидную связь между гуанилатом и остатком гистидина. Гуанилатная группа переносится на 3'-фосфатный конец субстрата, образуя кэпированную структуру [ДНК / РНК] -3 '- (5'-дифосфогуанозин). Когда подходящий 5'-ОН конец доступен, фермент катализирует атаку 5'-ОН на закрытом конце с образованием 3'-5'-фосфодиэфирного сплайсинга, высвобождая гуанилат. Воздействуя на 2 ', 3'-циклический фосфат РНК, фермент осуществляет дополнительную реакцию, гидролизируя циклический фосфат до 3'-фосфата [9]. Ферменту метазоа необходимы активирующие кофакторы для достижения катализа множественного оборота [8]. |
кофактор |
Mn2 + |
История |
|
Реакции |
(1) (Рибонуклеотид) (n) -3'-фосфат + 5'-гидрокси- (рибонуклеотид) (m) + Gtp = (рибонуклеотид) (n + m) + gmp + дифосфат. (2) (Рибонуклеотид) (n) -2 ', 3'-циклофосфат + 5'-гидрокси- (рибонуклеотид) (m) + Gtp + H (2) O = (рибонуклеотид) (n + m) + gmp + дифосфат (общая реакция). |